Le premier herbier de l'île Maurice fut créé en 1831 par Wencelaus Bojer et Louis Bouton, deux membres fondateurs de la Société Royale des Arts et des Sciences de l’Ile Maurice, et éminents botanistes de leur temps.

Ces deux botanistes contribuèrent grandement à approfondir la connaissance de la flore de l'île et publièrent plusieurs ouvrages dont les plus remarquables furent : Hortus Mauritianus, par Bojer, paru en 1837, et Histoire des Plantes Médicinales de Maurice, par Bouton, sorti de presse en 1856. Ces travaux apportèrent à la botanique mauricienne une reconnaissance scientifique internationale par l'étendue, la rigueur et l'utilité de leur contenu. Le Mauritius Herbarium, fondé en 1960 à la Mauritius Sugar Industry Research lnstitute (M.S.l.R.l.), a hérité une bonne partie des collections de ce premier herbier qui en est donc le noyau.

Plus tard, d'autres membres de la Société ajoutèrent à ces premières réalisations d'importantes découvertes dans des domaines voisins, notamment en écologie et en taxonomie des plantes. Il s'agit des Drs Reginald E. Vaughan et Paul Octave Wiehé qui publièrent plusieurs travaux de premier ordre. Ils initièrent la publication de la collection Flore des Mascareignes suite à un accord entre les Gouvernements de Maurice, La France et la Grande Bretagne, représentés dans ce projet par l'Institut de Recherches de l'Industrie Sucrière, l'Institut de recherche pour le développement (ex-ORSTOM), à Paris, et le Royal Botanic Gardens, à Kew, respectivement.

Dr Reginald E. Vaughan.                                       Dr Paul Octave Wiehe

Cette collection constitue une source unique de documentation sur la taxonomie, la répartition géographique et la densité des espèces végétales connues à Maurice, Rodrigues et La Réunion. Plusieurs nouvelles espèces endémiques furent décrites, dont certaines nommées en l'honneur de ces deux éminents botanistes, tels l'ébénier Diospyros revaughanii et le vacoas Pandanus wiehei.

Joseph Guého, membre honoraire de la Société, fut le conservateur de l'Herbier de 1983 à 1996. Infatigable botaniste, il redécouvrit, entre autres, le Trochetia boutoniana (dont la fleur, appelée Boucle d'oreille, est la fleur nationale de l'île Maurice) et l'Hibiscus genevii que l'on croyait disparus, car n'ayant pas été revus depuis plus d'un siècle. Il contribua aussi considérablement au projet Flore des Mascareignes et publia plusieurs ouvrages sur la végétation de Maurice, dont certains avec Guy Rouillard, autre membre de la Société.

De 1831 à 2016, l'Herbier aura collectionné, préservé, décrit et répertorié, pour les générations futures, plus de 25,000 échantillons de plantes; constitué une vaste collection d'ouvrages spécialisés sur la flore des îles Mascareignes; publié 26 volumes de référence sur près de 2500 espèces appartenant à plus de 212 familles de plantes, et collaboré à plusieurs comités nationaux et internationaux sur la recherche botanique.

A partir de 2012, avec la restructuration de l’Institut de Recherches de l’Industrie Sucrière de Maurice, l’Herbier de Maurice opère sous l’égide du Ministère de l’Agro Industrie et de la Sécurité Alimentaire, même si physiquement il est toujours situé dans les locaux du MSIRI à Réduit.

En 2010, le contrat de la maintenance de cette réserve privée passa au Mauritius Wilflife Fondation.